Le laboratoire Central et le réseau des laboratoires décentralisés de l’ONEE ont pour mission essentielle de contrôler la qualité des ressources en eau ainsi que la qualité de l’eau potable distribuée.
Ils s’assurent que l’eau potable ne contient ni substances gênantes ou toxiques, ni germes pathogènes et ils vérifient qu’elle est bien conforme aux normes de potabilité (NM 03.7.001).

Les laboratoires interviennent également dans l’évaluation des ressources destinées à l’AEP et dans l’identification de pollutions potentielles afin de prendre les mesures préventives qui s’imposent.
Enfin, ils fournissent de précieux renseignements pour l’optimisation et le suivi de l’exploitation des stations de traitement d’eau.

Par ailleurs, les laboratoires interviennent aussi dans l’assainissement et la protection de l’environnement en veillant au respect de la réglementation en vigueur portant fixation des valeurs limites spécifiques de rejet domestique. (Arrêté n° 1607-06) et la qualité des eaux usées épurées destinées à l’irrigation (Arrêté n° 1276-01).

Pour accomplir cette mission, les laboratoires disposent d’outils performants d’analyses et de contrôles, dont la fiabilité est assurée par un système d’assurance de la qualité des analyses.